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Allysine, proline et chimie de la substance intercellulaire

Cette partie d’Hemimorphitara avance réaction après réaction : le fonctionnement de la lysyl oxydase et de la prolidase, les ponts qui naissent dans les fibres et la façon de lire chaque allégation européenne pour elle seule.


Parcours de la page

  1. Le parcours d’une molécule de collagène
  2. La lysyl oxydase vue de près
  3. La prolidase vue de près
  4. Lire le texte du règlement à la lettre
  5. Questions en suspens sur la chimie des fibres

Le parcours d’une molécule de collagène

Une molécule de collagène passe par plusieurs lieux avant d’appartenir à une fibrille capable d’encaisser une charge, puis elle est de nouveau décomposée en ses unités. Le tableau classe les étapes utiles à cette page. Deux d’entre elles dépendent de l’un des oligo-éléments décrits ici ; les autres figurent comme points de repère.

ProcessusLieu où il se dérouleEnzyme catalyseurMétal de l’enzyme
Synthèse des chaînes protéiquesribosomes du réticulum endoplasmiqueaucune au sens stricthors sujet ici
Enroulement en triple héliceréticulum endoplasmiqueprotéines chaperonshors sujet ici
Coupure des extrémitésjuste à l’extérieur de la celluleprotéinases du procollagènehors sujet ici
Oxydation de résidus de lysine choisissurface de la fibrille en croissancelysyl oxydasecuivre
Formation des pontsentre molécules voisinesréaction spontanéeaucune enzyme en jeu
Coupure des dipeptides à prolinecytoplasmeprolidasemanganèse

Pourquoi une fibrille doit être pontée

Des molécules de collagène tout juste assemblées ne tiennent ensemble que par de faibles liaisons non covalentes. Les ponts covalents qui se forment dans les jours suivants relient l’extrémité d’une molécule à l’hélice de sa voisine décalée. Un faisceau de brins parallèles devient ainsi un fil qui répartit les forces de traction sur toute sa longueur.

Pourquoi le collagène est ensuite dégradé

La matrice n’est pas un ouvrage terminé. Les cellules dissolvent sans relâche des fibrilles anciennes et les remplacent. Environ un quart des acides aminés du collagène sont de la proline ou de l’hydroxyproline, si bien que la dégradation laisse un nombre inhabituel de fragments porteurs de ce cycle. La section sur la prolidase décrit comment l’organisme les récupère.


La lysyl oxydase vue de près

La lysyl oxydase est une petite enzyme sécrétée par les cellules. Elle naît sous la forme d’un précurseur plus long et n’est pleinement active qu’après la coupure d’un propeptide hors de la cellule. Des enzymes apparentées de la même famille suivent le même principe, mais diffèrent par leurs autres régions.

Un cofacteur tiré de sa propre charpente protéique

La plupart des enzymes qui oxydent des amines reçoivent de l’extérieur leur cofacteur organique, dérivé d’une vitamine. La lysyl oxydase le fabrique elle-même : une tyrosine de sa chaîne est oxydée puis unie à une lysine de cette même chaîne. Le produit s’appelle lysyl-tyrosyl quinone, ou LTQ. Cette autofabrication requiert déjà l’ion cuivre, qui, dans l’enzyme achevée, se trouve tout contre la LTQ.

Le métal mis en place avant la sécrétion

Le cuivre ne rejoint pas l’enzyme une fois dans la matrice. Dans la partie tardive de l’appareil de Golgi, l’ATPase à cuivre ATP7A pompe des ions vers l’intérieur des vésicules membranaires où la lysyl oxydase nouvellement formée attend sa sortie. L’enzyme quitte donc la cellule avec son métal déjà en place.

De la lysine au pont

Dans le site actif, l’oxygène détache le groupe aminé placé au bout d’une chaîne latérale de lysine. On obtient de l’allysine, porteuse d’un groupe aldéhyde ; l’hydroxylysine donne de même l’hydroxyallysine. L’ammoniac et le peroxyde d’hydrogène quittent l’enzyme comme sous-produits. Les réactions de condensation qui suivent se déroulent sans catalyseur et varient selon la protéine fibreuse.

Protéine fibreusePont mature caractéristiqueChaînes latérales en jeu
CollagènePyridinoline, désoxypyridinolinetrois, issues de lysine ou d’hydroxylysine
Collagène (forme précoce)aldimines et cétoamines bivalentesdeux
ÉlastineDesmosine, isodesmosinequatre résidus de lysine, dont trois oxydés au préalable
ÉlastineLysinonorleucinedeux

La desmosine et l’isodesmosine ne se rencontrent pour ainsi dire que dans l’élastine. Leur cycle pyridinium relie jusqu’à quatre chaînes en un seul point, ce qui explique que le réseau d’élastine puisse s’étirer sans se disloquer. L’allégation autorisée pour le cuivre est la suivante :

« Le cuivre contribue au maintien de tissus conjonctifs normaux »

Conformément au Règlement (UE) n° 432/2012


La prolidase vue de près

La prolidase agit dans le cytoplasme, soit à l’autre bout du chemin entamé par la lysyl oxydase. Ses substrats sont des dipeptides dont le second acide aminé est une proline ou une hydroxyproline. Les spécialistes les nomment imidodipeptides.

Pourquoi la proline exige sa propre voie de dégradation

À proprement parler, la proline n’est pas un acide aminé mais un acide iminé : son azote fait partie d’un cycle à cinq atomes. La liaison peptidique qui touche cet azote est plus encombrante que d’habitude et peut adopter deux positions dans l’espace. Les dipeptidases ordinaires reconnaissent mal cette forme. Sans enzyme spécialisée, les fragments de deux acides aminés contenant de la proline resteraient inutilisés.

Un hydroxyde pris entre deux ions manganèse

Les analyses structurales montrent l’enzyme humaine comme une paire de deux sous-unités identiques. Chacune possède un site actif à deux emplacements métalliques, occupés par du manganèse dans les conditions physiologiques. Les ions retiennent entre eux un ion hydroxyde. Celui-ci attaque le groupe carbonyle de la liaison peptidique, pendant que les métaux stabilisent l’intermédiaire qui se forme. Le dipeptide se scinde et les deux acides aminés sont libérés.

Enzyme dépendante du manganèseCe qui est coupé ou reliéLien avec la matrice
Prolidasecoupe les dipeptides terminés par une proline ou une hydroxyprolinelibère la proline issue de la dégradation du collagène
plusieurs glycosyltransférasesaccrochent des sucres activés à des chaînes en croissancechaînes de sucres des protéoglycanes
hyaluronane synthasesassemblent en alternance deux sortes de sucresacide hyaluronique de la substance de remplissage ; le magnésium convient aussi ici

Pour plusieurs glycosyltransférases, le manganèse peut être en partie remplacé par d’autres ions divalents lors d’essais en laboratoire. On ne peut donc pas dire avec la même certitude, pour chaque enzyme, quel ion est réellement fixé dans les tissus. Pour le manganèse, l’UE a autorisé l’allégation que voici :

« Le manganèse contribue à la formation normale de tissus conjonctifs »

Conformément au Règlement (UE) n° 432/2012


Lire le texte du règlement à la lettre

Le Règlement (UE) n° 432/2012 recense les allégations de santé utilisables dans l’Union. Chacune s’appuie sur un avis de l’Autorité européenne de sécurité des aliments et s’assortit de conditions, par exemple une quantité minimale dans le produit. Au sujet du tissu conjonctif, on y lit les inscriptions suivantes :

Inscription du manganèse

« Le manganèse contribue à la formation normale de tissus conjonctifs »

Conformément au Règlement (UE) n° 432/2012

Inscription du cuivre

« Le cuivre contribue au maintien de tissus conjonctifs normaux »

Conformément au Règlement (UE) n° 432/2012

Formation et maintien ne désignent pas la même chose

La phrase consacrée au manganèse parle de formation ; celle consacrée au cuivre parle de maintien. Ces formulations sont issues de procédures d’évaluation séparées et reproduites ici sans retouche. On ne peut ni les fondre en un énoncé commun, ni appliquer l’une à l’autre élément. Toutes deux décrivent un état normal, sans aucun changement au-delà.

Les quantités qui figurent sur l’étiquette

Dans l’UE, les étiquettes rapportent les quantités de minéraux aux valeurs nutritionnelles de référence de l’annexe XIII du Règlement (UE) n° 1169/2011 : 2 mg par jour pour le manganèse, 1 mg par jour pour le cuivre. Les chiffres ci-dessous sont arrondis et peuvent s’écarter nettement selon l’origine et la transformation.

Ingrédient, pour 100 gManganèseCuivre
Noisettes décortiquéesenviron 6 mgenviron 1,7 mg
Flocons d’avoineenviron 4 mgenviron 0,4 mg
Poudre de cacao maigreenviron 3,8 mgenviron 3,8 mg
Lentilles sèchesenviron 1,4 mgenviron 0,8 mg

Questions en suspens sur la chimie des fibres

De quoi dépend le nombre de ponts ?

Le nombre de ponts formés dépend de la quantité de lysyl oxydase produite par les cellules, du nombre de résidus de lysine accessibles sur la fibrille et du temps laissé à la réaction. L’ion cuivre conditionne l’activité de l’enzyme, mais ce n’est pas un curseur qui ferait grimper la quantité de ponts. L’allégation autorisée ne décrit pas davantage de hausse.

La prolidase est-elle une collagénase ?

Non. Les collagénases font partie des métalloprotéinases matricielles et entaillent la triple hélice intacte hors de la cellule. La prolidase n’intervient qu’à la toute fin de la dégradation, à l’intérieur de la cellule, et ne coupe plus que des fragments de deux acides aminés. Les deux enzymes appartiennent au même cycle, mais y remplissent des tâches sans rapport entre elles.

Pourquoi « formation » pour le manganèse et « maintien » pour le cuivre ?

Les formulations ont été arrêtées pour chaque élément au fil de procédures autonomes. Les enzymes de cette page éclairent le contexte biochimique, sans pour autant justifier le choix des mots du règlement. Voilà pourquoi Hemimorphitara ne reproduit chaque phrase qu’aux côtés de son élément.

Sur quelles sources reposent les descriptions d’enzymes ?

L’exposé s’appuie sur des manuels de biochimie et de biologie de la matrice, sur les structures cristallines publiées de la prolidase humaine et sur des articles de synthèse consacrés à la famille des lysyl oxydases. Le libellé des deux allégations provient du Règlement (UE) n° 432/2012 paru au Journal officiel de l’Union européenne.


Cahier de travail sur la chimie des fibres

Schémas réactionnels de la lysyl oxydase et de la prolidase, deux tableaux d’enzymes et le texte intégral des deux allégations européennes, chacune rattachée à son élément.

49,00 € TTC

Accès unique · Produit d’information numérique

Le délai légal pour exercer la rétractation est de 14 jours ; les conditions applicables sont détaillées sur la page Droit de rétractation.


Avis de santé

Les textes d’Hemimorphitara transmettent des connaissances de fond en biochimie. Ils ne sauraient tenir lieu de diagnostic, de proposition thérapeutique ni d’échange avec votre médecin, surtout en présence de troubles, pendant une grossesse ou lors de la prise de médicaments.

Un complément alimentaire ne rattrape ni une alimentation peu variée ni un mode de vie peu sain ; l’une et l’autre restent le socle. Qui utilise une telle préparation s’en tient à la quantité journalière inscrite sur la boîte, ou reste en dessous. La boîte se range à un endroit que les jeunes enfants ne peuvent pas atteindre.

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